偏最小二乘判别分析 | 一、偏最小二乘判别分析简介 | |
偏最小二乘判别分析(PLS-DA)与主成分分析不同,是一种有监督的学习方法,即在建模时用到分组标签的信息。在建立PLS-DA模型时,需要事先指定用于建模的主成分,不同的主成分数对应着不同的PLS-DA模型,一般按照一定的准则选取前面几个主成分建立PLS-DA模型。基于所建立的PLS-DA模型,可计算衡量对模型贡献大小的VIP值。近年来,PLS-DA方法在代谢组学研究中得到了广泛的应用,并成为一种标准的高维数据分析方法。代谢组学中常利用VIP值进行变量筛选,如VIP>1。 二、数据格式 |
||
![]() |
||
![]() |
||
|
||
三、输出结果展示 | ||
输出结果包括模型的R2X、R2Y、Q2、VIP值和PLS-DA得分图。下载表格中,提供所有自变量的VIP值。 示例如下: ![]() |